# 16S- & 28S-Amplikon-Sequenzierung

> GINA & PCR-Box funktionieren auch außerhalb des hybcell-Workflows: als Probenvorbereitung und PCR für Ihre eigene 16S- und 28S-Amplikon-Sequenzierung – Sanger oder NGS.

### Amplikon-Sequenzierung · 16S / 28S, Sanger oder NGS
**16S** pan-bakterielle PCR · plus 28S pan-fungal

PCR-Box Bacteria ist ein pan-bakterieller 16S-PCR-Mix, PCR-Box Fungi ein pan-fungaler 28S-PCR-Mix. Neben compact sequencing auf der hybcell eignen sich die Amplikons für 16S- und 28S-Sequenzierung nach aktuellem Stand (Sanger, NGS). Aus Vollblut depletiert GINA zuerst humane DNA und reichert die mikrobielle DNA an.


- Probenvorbereitung: Anreicherung der Mikroben
- Probenvorbereitung: DNA-Extraktion
- Probenvorbereitung: Säulen oder magnetische Beads

- Gebrauchsfertige PCR-Mixe, Einzelreaktionen in 0,2-mL-Gefäßen
- Äußerst sensitiv, mit der Möglichkeit der RNA-Transkription
- Hot-Start-Funktionalität und UNG als Carry-over-Schutz
- Hergestellt unter Reinraumbedingungen

Ablauf:

01. Probenvorbereitung: GINA 500
02. DNA-Extraktion & PCR: GINA DNA Purification, DNA-Extraktion anderer Hersteller, PCR-Box Bacteria, PCR-Box Fungi
03. Sequenzierung: Sanger (Fremdprodukt), NGS (Fremdprodukt)

## 16S-Sequenzierung – Literatur
Die cube dx PCR wurde mit In-house-PCR und 16S-Sequenzierung verglichen:

- 2026: [Performance comparison to in-house PCR and 16S sequencing](https://www.cubedx.com/literature/ESCMID2026POSTER-ComparisonPCR16SHAUKELANDUNIVERSITY.pdf)